Der IDB-CS kann Daten aus Laboren für Empfänger wie z.B. Arztpraxen zur Verfügung stellen. Ebenso übermittelt der IDB-CS Laboraufträge an das jeweilige Labor. Diese Formen des Transfers werden vom IDB-CS überwacht und dokumentiert.
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Der IDB-CS ist in der Lage, Daten aus Laboren, welche im LDT-Format vorliegen, einzulesen und an Empfänger weiterzuleiten. Die Labordaten (Laborberichte und –aufträge) müssen dazu als Dateien vorliegen, die gem. der Datensatzbeschreibung 'Labordatenträger LDT' Version LDT1001.01 aufgebaut sind. Diese Datensatzbeschreibung ist von der Kassenärztlichen Bundesvereinigung (KBV) veröffentlicht worden.
Es ist sowohl eine Verarbeitung von Laborberichten (vom Labor an eine Praxis o. ä.) wie auch eine Verarbeitung von Laboraufträgen (von einer Praxis ans Labor) möglich.
Die Dateien von den Laborsystemen werden vom CS eingelesen und geprüft. Für die Empfänger werden die Daten sofort oder zu definierten Zeiten zur Verfügung gestellt.